Шейх Али Джума родился 3 марта 1952 года в Бани Сувайф (Верхний Египет). Али Джума был воспитан в религиозной семье, в которой ценилось знание. Его отец, юрист, специализирующийся на личном статусе мусульманского права, передал сыну любовь к книгам, частная библиотека которого теперь имеет более чем 30 000 наименований. К ней обращаются студенты и исследователи со всего мира, нуждающиеся в редких текстах.

В 10 лет Шейх Али начал заучивать Коран наизусть. К тому времени, когда он закончил среднюю школу, он уже изучил шесть канонических сборников хадисов и фикх маликитского мазхаба, несмотря на то, что не учился в религиозных учебных заведениях. Когда настало время поступать в колледж, перед Али Джума встал выбор: поступать на факультет инженерии или на факультет торговли. Он выбрал учёбу на факультете торговли, так как у него было свободное время, чтобы продолжить изучение религии, начатое ещё в школе.

После окончания колледжа Шейх Али поступил в университет аль-Азхар. В первый год учёбы он запоминал наизусть многие основополагающие тексты, которые другие студенты уже изучили в колледже при аль-Азхар. Это были труды по фикху, арабской грамматике, декламации Корана и методологии хадиса. В 1979 году после получения второй степени бакалавра Шейх Али поступает в магистратуру и в 1985году получает степень магистра. В 1988 году Шейх Али Джума становится Доктором. В дополнение к основной учёбе Шейх Али проводил время со многими шейхами и устазами шариатских наук и тасаввуфа вне университетской программы.